پس از آنکه ادعا می‌شود مریم مقدس بر دختری جوان به نام آلیس که دچار کم‌شنوایی است ظاهر شده، او به‌طور غیرقابل‌توضیحی توانایی شنیدن، صحبت کردن و درمان بیماران را به دست می‌آورد. با گسترش خبر، مردم از نزدیک و دور برای تماشای معجزاتش به شهر کوچکی در نیوانگلند می‌آیند. در این میان، یک خبرنگار بی‌اعتبار که به دنبال احیای دوباره‌ی حرفه‌اش است، برای تحقیق به آنجا می‌رود. اما با شروع رخدادهای هولناک، او کم‌کم به این شک می‌افتد که این پدیده‌ها واقعاً کار مریم مقدس هستند یا چیزی بسیار شوم‌تر و تاریک‌تر پشت ماجرا نهفته است.

پس از تلاش‌های دشوار برای بارداری، آرزوهای توری برایر برای مادری با ورود یک نوزاد پسر مرموز به حقیقت می‌پیوندد. براندون به نظر می‌رسد همه چیزهایی است که توری و همسرش، کایل، همیشه می‌خواستند: باهوش، بااستعداد و کنجکاو درباره جهان. اما با نزدیک شدن براندون به سن بلوغ، تاریکی قدرتمندی در درون او ظاهر می‌شود و توری را دچار تردیدهای وحشتناکی درباره پسرش می‌کند. وقتی براندون شروع به عمل کردن بر اساس تمایلات پیچیده‌اش می‌کند، نزدیک‌ترین افراد به او خود را در خطر جدی می‌یابند.

در پس‌زمینه یک جنگ کهنه و پنهان میان خاندان پیچیده و ظریف خون‌آشام‌ها و قبیله وحشی گرگینه‌ها، سلن، قاتل خون‌آشام و عضو گروه نخبه «مرگ‌سازها»، تمام وجود خود را وقف از بین بردن آخرین نقاط پراکنده گرگینه‌ها در زمین کرده است. با مرگ سرکرده عالی‌رتبه گرگینه‌ها، لوکین، پیروزی خون‌آشام‌ها نزدیک به نظر می‌رسد؛ اما زمانی که دشمنان همیشگی آنها توجه خاصی به یک پزشک انسان به نام مایکل کُروین نشان می‌دهند، سلن توطئه‌ای دیرینه را کشف می‌کند. اکنون، خیانت، فریب و احساسات متناقض در مسیر حقیقت قرار دارند و سلن مجبور می‌شود برای نجات نژاد خون‌آشام‌ها از پروتکل‌ها عبور کند. آیا یک رابطه ممنوعه می‌تواند ماموریت شجاعانه او را به خطر بیندازد؟ آیا این آغاز یک عصر جدید و جنگی کاملاً متفاوت است؟

آلیس از خوابی وحشتناک بیدار می‌شود و می‌بیند که بدترین ترس‌هایش به حقیقت پیوسته‌اند؛ مردگان زنده، که او و تیم ارتش نخبه‌اش برای نابودی‌شان مبارزه کرده بودند، اکنون در شهری که در اطراف تأسیسات مخفی شرکت آمبرلا قرار دارد، آزاد شده‌اند. آلیس متوجه می‌شود که او خود یک آزمایش از طرف آمبرلا بوده و به‌طور بیولوژیکی تقویت شده است و اکنون قدرت‌ها، حواس و مهارت‌های جدیدی دارد که برای زنده ماندن به آن‌ها نیاز دارد. در دل شهر ویران‌شده راکون، گروه کوچکی از افراد غیر آلوده، از جمله جیل والنتاین، که اخیراً از تیم نجات و تاکتیک‌های ویژه راکون سیتی تنزل رتبه داده است، و کارلوس اولیویرا، افسر امنیتی شرکت آمبرلا، برای جان خود می‌جنگند تا در برابر حملات انبوه مردگان زنده و "لیک‌ها"ی سریع‌تر و کشنده‌تر مقاومت کنند. وقتی منابعشان تمام می‌شود و شانسشان کم می‌شود، این گروه توسط آلیس نجات پیدا می‌کنند و تصمیم می‌گیرند برای بقا و فرار از دست آمبرلا مبارزه‌ای نفس‌گیر را آغاز کنند، قبل از اینکه این شرکت آزمایشات خود را از روی زمین پاک کند. تنها امید آن‌ها در جایی در راکون سیتی است، جایی که دکتر چارلز اشفورد، یکی از دانشمندان برجسته شرکت آمبرلا، به آلیس و بقیه کمک خواهد کرد تا از شهر فرار کنند، اما به شرطی که آن‌ها دخترش را پیدا کنند. آنجلیش اشفورد از پدرش جدا شده و اکنون در ترس پنهان شده است. آلیس، جیل و کارلوس باید از میان ارتش مردگان زنده عبور کنند تا او را نجات دهند. در همین حال، سلاح سری به نام نمسیس که با تغییرات بیشتری نسبت به آلیس آزمایش شده، برای پیگیری و نابودی آن‌ها برنامه‌ریزی شده است. آن‌ها باید تمام توان و مهارت‌های خود را به‌کار گیرند تا در برابر شر بی‌مغزی که شهر را آلوده کرده و نیروهای قدرتمندی که آن را بر بشر آزاد کرده‌اند، به نبردی نهایی بپردازند.